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文章链接:http://www.genedenovo.com/uploads/tmp/genedenovo-resume-1438571734.7158723.pdf

一、文章总体架构
这是典型的:(现象  + 分析)逻辑型的文章。 这类文章逻辑相对简单清晰。
1)先有某种处理导致某些宏观现象;
2)再使用某类技术(例如转录组测序、16s meta测序)观测微观指标,对宏观现象进行解释。

这篇文章的整体模式如下:
1、宏观现象: 
胖瘦组的小鼠在相同的饲喂策略下,体重发生不同的变化模式;
2、微观解释:
使用16s meta 测序分析胃肠道微生物群落变化,与宏观体重发生变化进行关联,并对其进行部分解释。

二、实验设计
建立动物模型:“高油脂摄入组”组,培养胖子小鼠;“低油脂摄入”组,培养瘦子小鼠;挑选5只胖子构成胖组,5只瘦子构成瘦组,然后同时饲喂高低聚果糖饲料 8 周,然后分析的体重变化。
简单理解:分两组小鼠,服用保健食品2个月,然后研究保健品的作用。

三、文章结果
这篇文章结果部分逻辑比较简要:
1. 宏观现象
    瘦组小鼠(FL)和胖组小鼠(FO),都使用高低聚糖饲料饲喂,并在11、15、19周龄检测体重。
   发现有两点:
   1.1 两组体重都在增长;
   1.2 瘦组小鼠增长更快;

2. 微观 16s meta 多样性分析
    主要在胃肠道环境微生物多样性方面,主要从三点阐述其与宏观现象间的关键:
     2.1 不同组次肠道微生物多样性的区别;
     2.2 不同组次的聚类分组特点;
     2.3 具体到个别微生物类群上,不同组次间的区别; 

2.1不同组次肠道微生物多样性的区别;
保健品可以养肠胃,所以两组小组的肠道生物多样性一直在提高。
从香农指数来看,瘦组小鼠(FL),在第一个时期多样性极低,而在第二个时期显著提高;胖组小鼠(FO),一开始的多样性就较高,但在第三个时期又有显著升高。

2.2不同组次肠道微生物多样性的区别;
从PCA分析的结果来看,在摄入早期胖组和瘦组的小鼠差别明显。而到了中后期,就几乎没有差别了(因为养肠胃都养的不错)。

2.3具体到个别微生物类群上,不同组次间的存在区别。
例如,瘦组小鼠在早期有更低Bacteroidetes 丰度,而这似乎与它们的能量吸收效率有关。


小结
1、这篇文章结构简单,在典型的现象 + 分析解释的文章,这类思路发三份左右的期刊还是可以的。(Food &Function的IF ≈ 2.8)。
2、瘦子小鼠吃了健康食品为什么还增重更大。我认为其实原因很简单,光吃不运动,再好的减肥茶也没用。而胖子基础已经很好,要再提高成绩自然就难了,瘦子当然有更大的提高空间。

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