靶向代谢组

靶向代谢组学针对性分析生物样本中单个或少量目标代谢物,通过与标准品的比对分析等获得目标代谢物的绝对丰度信息。随着分析研究的逐步深入,代谢网络逐渐全面系统,生物学研究趋于具体代谢通路的细节探索。靶向代谢组学即在精细化的代谢组学研究中发挥着重要作用。

应用领域
1.生物标记的验证和绝对定量
2.目标代谢通路
3.组学间补充验证


技术路线

分析内容
1. 物质标准曲线制备
2. 原始数据预处理
3. 物质绝对定量

样品要求
1.动物组织立即分割成2-4mm小块,200mg 鲜样,立即液氮冷冻;
2.藻类:冻干粉 30-40mg, 或鲜样 300mg

3.混合来自 3 个以上的植株组织为一份样品,动物组织如需混样,双方提前沟通;
4.植物样品需要冷冻干燥,请尽量提供鲜重3g,激素检测,请尽量提供鲜重1g)

5.血液类样本,血液抽至抗凝离心管,立即低温离心收集血浆、血细胞,立即液氮冷冻;
6.样品需 -80°保存,干冰运输,不能反复冻融。

项目周期
约2个月

应用案例
1.Wang, Rui, et al. "Identification of novel pathways for biodegradation of bisphenol A by the green alga Desmodesmus sp. WR1, combined with mechanistic analysis at the transcriptome level." Chemical Engineering Journal.321 (2017): 424-431.
2.Tieman D, Zhu G, Resende M F R, et al. A chemical genetic roadmap to improved tomato flavor[J]. Science, 2017, 355(6323): 391-394.
3.Yu C, Zhao X, Qi G, et al. Integrated analysis of transcriptome and metabolites reveals an essential role of metabolic flux in starch accumulation under nitrogen starvation in duckweed[J]. Biotechnology for Biofuels, 2017, 10(1): 167.
4.Liu K, Feng S, Pan Y, et al. Transcriptome Analysis and Identification of Genes Associated with Floral Transition and Flower Development in Sugar Apple (Annona squamosa L.)[J]. Frontiers in Plant Science, 2016, 7.