应用领域
技术路线
分析内容
1. 标准信息分析 | 2. 定制化信息分析 |
a) 数据产出统计
b) 蛋白数据库建立与PEAKS DB软件搜索
c) 蛋白质鉴定与定量
d) 蛋白质功能注释(GO功能、KEGG代谢通路、COG/KOG)
e) 蛋白质高级注释(蛋白结构域注释、转录因子注释、亚细胞定位分析)
f) 样本关系分析
g) 差异蛋白分析(差异火山图、差异比较热图)
h) 差异蛋白GO/KEGG/DO/Reactome功能富集分析(DO仅限人、Reactome仅限部分物种)
i) GSEA分析(GO/KEGG/DO/Reactome,DO仅限人、Reactome仅限部分物种)
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a) 蛋白质组与转录组关联分析
b) 蛋白互作网络分析
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参考文献
玉米蛋白质组研究盐胁迫
研究背景
实验取材
耐盐品系Jing724 和敏感品系D9H在无盐(对照)和100 mM盐中培养7天,随后取根进行itraq测序,每组3个生物学重复。
研究思路
研究结果