医学非靶向代谢组

非靶向代谢组学全面检测生物样本中所有低分子量代谢物,通过平台检测、谱图分析、数据库比对等获得样本中代谢物种类和相对丰度信息。由于代谢组受环境变化影响最大,而环境对生物体的影响也最终体现为代谢物的变化,代谢组学研究在疾病诊断、药物研发等医学领域的应用越来越广泛。

应用领域
1.疾病诊断的生物标记biomarker
2.疾病的发生发展机制
3.复杂疾病致病基因与易感基因鉴定
4.药物研发、治疗机制

技术路线

分析内容
1.数据预处理:基线过滤、峰识别、积分、保留时间校正等;
2.代谢物定性定量:通过数据库比对进行代谢物鉴定,通过峰图进行相对定量等;
3.数据分析:多元统计分析(PCA、OPLS-DA分析)、差异代谢物筛选、代谢通路分析等;
4.其他高级分析及个性化分析:如多组学关联分析等。

样品要求
1.动物组织:立即放入液氮中,速冻至少15min,-80℃保存,200mg 鲜样;
2.粪便、肠道内容物:叠氮化钠处理,立即放入液氮中,速冻至少15min,-80 ℃保存,200mg 鲜样;
3.血清:室温静置离心,取上清低温离心,-80℃保存,200ul;
4.血浆:肝素钠抗凝管采集全血,室温离心,-80℃保存,200ul;
5.细胞:淬灭缓冲液, -80℃甲醇重悬,液氮中速冻至少15min,-80℃保存,500 万个/例或 107 个细胞;
6.微生物:淬灭试剂,低温离心,-80℃保存,107 个细菌或 500mg 菌丝;
7.尿液:叠氮化钠处理,-80 ℃保存,1ml。

项目周期
约2个月

应用案例
1.Brunelli L, Caiola E, Marabese M, et al. Capturing the metabolomic diversity of KRAS mutants in non-small-cell lung cancer cells[J]. Oncotarget, 2014, 5(13): 4722-31.
2.Mitchell S J, Bernier M, Aon M A, et al. Nicotinamide Improves Aspects of Healthspan, but Not Lifespan, in Mice[J]. Cell metabolism, 2018, 27(3): 667-676.