小基因组de novo测序

小基因组主要包括线粒体、叶绿体、病毒、质粒等,由于这些基因组大小通常小于1M,因此统称为小基因组。基于高通量测序技术,对小基因组进行全基因组测序,可以得到其全基因组序列,并预测其重要的功能基因。基于全基因组序列,对于线粒体/叶绿体可以进一步研究物种分类、进化关系等;对于病毒、质粒可以则可以进一步研究致病性、与宿主的相互作用等。

应用领域
1、物种分类地方鉴定
2、物种进化分析

技术路线

分析内容
基因组组装
基因组分预测
进化分析等

样品要求
1) 样品类型: DNA;
2) 样品需求量:小基因组扫描图:基因组DNA ≥2μg ;小基因组完成图:基因组DNA ≥10μg;
3) 样品浓度:≥30ng/µL;
4) 样品纯度:OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解,无污染;

项目周期
一般20-30个工作日,具体视基因组大小而定