修饰蛋白质组学分析

生物体内常见的蛋白质修饰包括磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化等,蛋白质修饰调节着蛋白质的活性状态、定位、折叠、功能以及蛋白之间的相互作用,在信号转导、细胞分化、细胞免疫、转录调控等多种细胞过程中发挥着重要作用。修饰蛋白组学是在蛋白修饰水平,对蛋白质修饰状态进行定性定量分析,获得不同处理或不同生理、病理状态下的蛋白修饰差异。

应用领域
细胞分化、细胞免疫等分子机制研究
疾病的发生发展机制
药物治疗机制

技术路线

分析内容
1. 标准信息分析

1.1 数据产出统计
1.2 修饰蛋白数据库建立与搜索
1.3 修饰蛋白质鉴定
1.4 修饰蛋白质注释
1.5 修饰蛋白质定量分析
1.6 修饰蛋白差异表达分析
1.7 差异修饰蛋白GO/KEGG功能富集分析

2. 定制化信息分析
修饰肽段motif分析(部分物种可做)

样本要求
1. 新鲜动物组织:≥600mg
2. 新鲜植物组织:≥6g
3. 新鲜培养细胞:≥1*107个细胞每管,3管
4. 真菌、细菌:≥600mg
5. 血清、血浆:450μl * 4管
6. 体液样本:尿液:15ml *4管(送样前需1000g离心5min,弃去沉淀),其他体液(唾液、羊水、细胞培养上清液等)要求15ml以上。
7. 蛋白溶液:蛋白总量5-10mg
#备注:乙酰化修饰送样量需按照以上要求的10倍来送。

项目周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。

参考文献
Den Eynden J V, Umapathy G, Ashouri A, et al. Phosphoproteome and gene expression profiling of ALK inhibition in neuroblastoma cell lines reveals conserved oncogenic pathways[J]. Science Signaling, 2018, 11(557).
Lao J P, Ulrich K M, Johnson J R, et al. The Yeast DNA Damage Checkpoint Kinase Rad53 Targets the Exoribonuclease, Xrn1[J]. G3: Genes, Genomes, Genetics, 2018
Belczacka I, Pejchinovski M, Krochmal M, et al. Urinary Glycopeptide Analysis for the Investigation of Novel Biomarkers[J]. Proteomics Clinical Applications, 2018.