今天跟大家介绍一种你们不熟悉的SCI论文——数据库介绍。
整篇SCI没有什么逻辑故事，没有深入浅出的验证，没有惊艳的图表，但发表在了2015年1月的《DATABASE》(IF:4.57)上。

本文中介绍的数据库是桑树转座子（ Transposable element，以下简称TE）数据库的。

文章结构非常简单，仅两个部分的介绍：

1、数据库数据的分析过程

这篇SCI前半部分的篇幅主要讲作者怎么做桑树转座子鉴定的，比如从头预测用了PILER和RepeatModeler的方法，然后又用了HMM、MITE-Hunter方法，及转座子家族区分等等，最后综合多种方法结果，完成桑树全基因组转座子的详尽精确的鉴定及分类，鉴定出了5925个转座子序列。

然后作者利用这些转座子序列，做了一个桑树转座子数据库。
网址：morus.swu.edu.cn/mntedb

2、数据库可视化界面的介绍
文章的后半部分，全部是讲这个这个数据库网站的界面及使用方法的。比如根据数据库页面的相应链接，我们不仅可以浏览、查询、下载感兴趣的转座子序列，同时数据序还提供了一些序列分析工具共大家使用。

然后作者巴拉巴拉讲了这个数据库的4个主要功能：

① 浏览

当我们打开这个数据库网站后，可以浏览数据库里面包含的5925个转座子所有信息，当然也可以查看各个超家族成员信息。

② 查询

如果你想看某个家族或某个序列信息，也可以在数据库网站直接输入序列ID、order名称或者超家族名称查询，序列信息也可以下载（好像还蛮不错的样子)。

③序列分析工具

你以为数据库就浏览查询功能吗，那就太easy了。然后作者介绍这个数据库网站还可以做序列分析，也是给跪了。

比如blast、GetORF、HMMER等常用分析工具被整合到了在线数据库中。

④ 其他信息

最后作者介绍了数据库网站其他信息，比如下载家族的相关信息及序列，还有数据库还可以链接到一些转座子分析软件等等。

over，这篇SCI内容基本就讲完了。最后，这个桑树转座子数据库是基迪奥搭建的噢。只要在我们这里做10万以上的RNA相关项目，我们就免费搭建数据库。

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