应用领域
技术路线
分析内容
标准信息分析 | 高级信息分析 |
1. 测序质量评估与原始数据过滤,去除接头序列及低质量reads
2. 比对参考基因组或参考基因序列
3. 测序与比对评估: 数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性分析
4. 基因表达统计:基因覆盖度,表达量,表达量丰度分布
5. 新基因的转录本预测及注释(需有参考基因组)
6. 样本关系分析:主成分分析(PCA)、相关性检验、样本聚类图
7. 差异表达基因分析(两个或两个以上样品): 差异表达基因筛选、差异基因表达模式聚类分析(热图)、差异基因GO功能显著性富集分析、差异基因Pathway显著性富集分析
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1. SNP分析
2. 基因结构优化(需有参考基因组)
3. 基因可变剪切鉴定(需有参考基因组)
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样品要求
项目周期
标准流程完成时间为50个工作日。
参考文献
案例一:Sm art-seq2揭示人cn 121+先天淋巴细胞的异质性
案例二:lOx scRNA-seq联合Smart-seq2绘制小肠细胞图谱
参考文献: