应用领域
技术路线
分析内容
标准信息分析(需提供参考基因序列、参考基因组序列及基因注释结果)
1. 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理
2. 比对参考基因组或参考基因序列
3. 测序与比对评估(数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性的统计分析)
4. 基因表达统计(基因覆盖度,表达量,表达量丰度分布)
5. 新基因的转录本预测及注释(需有参考基因组)
6. 样本关系分析(主成分分析(PCA)、相关性系数热图、样本聚类图)
7. 差异表达基因分析(两个或两个以上样品)
7.1 差异表达基因筛选
7.2 差异基因散点图与火山图
7.3 差异基因表达模式聚类分析(热图)
7.4 差异基因GO功能显著性富集分析
7.5 差异基因Pathway显著性富集分析
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高级分析(200bp链特异性建库,需要参考基因组)
1. 新转录本预测
2. 基因结构分析
3. 非转录区域(UTR)分析
4. sRNA分析
5. 反义转录本分析
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研究背景
实验设计
研究结果