应用领域
技术路线
分析内容
标准信息分析 | 高级信息分析 |
1. 测序数据统计与评估:各个样本测序数据基本质控(reads数、测序饱和度等)、各个样本数据比对(组织覆盖区域检测、reads基因组比对率等)、基因表达定量
2. spot聚类分群及数据可视化:spot聚类分群、分类结果可视化(组织映射图,tSNE映射图)
3. 亚群特征基因分析:亚群上调基因筛选、亚群上调基因功能富集分析、亚群特征基因筛选、亚群特征基因分布特征可视化、亚群特征基因蛋白质互作网络图
4. 空间特征基因分析:空间差异基因筛选、空间差异基因功能富集分析、空间特征基因筛选、空间特征基因分布特征可视化、空间特征基因蛋白质互作网络图
|
拟时分析
与单细胞转录组关联分析
|
样品要求
参考文献
案例一 肌萎缩性侧索硬化症致病机制
案例二 人类心脏发育空间表达图谱
参考文献: