一款好用的序列可视化工具 返回

工具地址:http://ibs.biocuckoo.org/

例如,这个工具可以画出这样的序列示意图

或者是下面这样的

还有这样的

这个工具就是IBS(Illustrator for Biological Sequences,生物序列绘制器)。它的主界面是这样的:

这个是在中山大学任间教授实验室开发的,有在线版和本地版,并且完全免费对外开放。
(介绍这个工具网站的文章已经以Letter to the Editor的形式发表在Cell Research上。目前已经被引用超过了100次。)
这个工具有本地版本及在线版本,本地版本满足各种系统需求。点击【web server】进入在线编辑版本,主界面效果如下:

既可以可视化蛋白序列,还可以可视化核酸序列,还可以在同一张图上可视化多条序列。
操作方便,可以直接点击上面工具栏添加元件,位点、结构域都很容易标识。


另外这个工具网站可以直接UniProt的注释信息,搜索蛋白质ID,可以自动绘制蛋白质功能结构域示意图。比如下图:


同时可以对任意元件精确设置,保证绘图效果。

 右边可以直接对元件进行修改删除:

画图完成后,还可以保存,可以导出矢量图/300dpi的图片,甚至可以导出600dpi的图片。

更多工具软件的使用可以登陆以下网址:
常见工具网站:http://genedenovoweb.ticp.net:81/gdtools/login.php
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