一个好用的批量设计引物工具 返回
今天跟大家推荐一个批量设计引物的在线工具，一次可以设计500条序列引物，并且是在线的，完全免费，速度也是很不错。
这个工具就是：BatchPrimer3。
网址：http://wheat.pw.usda.gov/demos/BatchPrimer3/
BatchPrimer3（以下简称“BP”）是基于 Primer3为核心开发的引物设计工具，BP可设计多种引物，包括通用引物，SSR引物设计和SSR检测，和SNP基因分型引物（包括单碱基延伸引物，等位基因特异性引物和四引物扩增受阻突变体系），以及DNA测序引物。
BP是由加州大学戴维斯分校的研究人员设计的，研究人员还专门写了一篇SCI介绍这个工具，发表在了《BMC Bioinformatics》上，目前这篇SCI已经被引用了298次。
首先，这个牛掰工具的首页是这样的：
左边菜单栏中，有3个服务器端口可供选择，而Server1端口速度最快，点击即可进入引物设计界面。如下：
可选择需要设计的引物类型。
一次可设计500条序列的引物。
跟据需求选择引物参数。
以网站的6条序列为例，点击“pick primers”,跳转引物结果网页，如下：
结果中列出了引物各参数。另外，如果是上百条序列，建议使用“Ctrl+F”快捷键查找自己关心的那条序列的引物。
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