NCBI教程|RefSeq各种命名规则 返回
NCBI RefSeq(美国国立生物技术信息中心参考序列库)是目前世界上最具有权威性的序列数据库,该数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。
我们在NCBI RefSeq 上找序列时,经常会看到各种标记的序列,但是不知道哪个才是想要的。
根据经验,如果想找标准序列,mRNA就采用NM_开头的,基因组用NC_或者AC_开头的。NR_表示不编码的RNA或假基因序列,AF开头的表示克隆序列,BC开头的表示模板序列。RefSeq一般的命名格式:前缀为两个字母,然后下横线(’_’)。区别于其它的GenBank的命名格式。
我们的技术人员收集了相关资料,找到了一些accession说明,请看下图。
详细可参考:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/key.html#accession
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