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活动时间
2017年11月1日~2018年1月31日

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基迪奥客户文章案例------硫氧还蛋白影响植株再生的研究
研究思路

研究结果
1.DCC1突变抑制拟南芥芽再生能力
为了确定Trxs在芽再生中的功能，利用T-DNA插入突变，发现七种Trxs中只有AT5G50100显著影响了芽再生，命名为DDC1（图1）。

图1  DCC1突变影响芽再生能力

2.DCC1或CA2通过上调ROS水平抑制芽再生
DCC1与CA2存在直接相互作用，DCC1或CA2突变显著下调线粒体呼吸复合物I（the mitochondrial respiratory complex I，Complex I）的活性，上调愈伤组织ROS水平（图2）。

图2  DCC1调控芽再生机制

3.ROS 通过调控多种信号通路影响芽再生
野生型拟南芥和DCC1突变型拟南芥RNA-seq分析结果发现，在突变组中，689个基因显著上调，2332个基因显著下调。GO富集分析显示DCC1调控多种生物学过程（图3）。

图3  野生型拟南芥和DCC1突变型拟南芥RNA-seq分析

4.DCC1在拟南芥芽再生的自然变异中扮演重要角色
利用48个不同生态型中的DCC1核酸序列进行连锁不平衡分析，发现了六个SNPs和芽再生频率高度相关，两个单倍型Hap1和Hap2确定了48个拟南芥的自然变异（图4）。

图4  DCC1调控不同生态型拟南芥芽再生能力

总    结
文章揭示了Trxs通过氧化还原重塑调控ROS内稳态，影响芽再生，阐明了影响拟南芥再生能力自然变异的分子机制，基迪奥有幸参与该项目，配合完成了拟南芥野生型和DCC1突变体的转录组测序及生物信息学分析，筛选到了影响芽再生的关键基因与信号通路。