应用领域
技术路线
分析内容
有参考基因组 | 无参考基因组 |
1. 基因组电子酶切评估 (必须基于参考基因组)
1.1 电子酶切评估统计
1.2 基因组染色体Tags统计
1.3 酶切位点的染色体分布
2. 测序数据评估
3. 原始数据过滤
4. 比对数据统计
5. Variant分析
5.1 SNP检测、注释与统计
5.2 InDel检测、注释与统计
6.群体结构分析
6.1群体主成分分析(PCA分析)
6.2群体进化树分析
6.3群体结构分析(STRUCTURE图分析)
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1. 测序质量评估
2. 原始数据过滤
3. GBS tag聚类/ RAD tag聚类和拼接
4. Variant分析
4.1 SNP检测、注释与统计
4.2 InDel检测、注释与统计
5.群体结构分析
5.1群体主成分分析(PCA分析)
5.2群体进化树分析
5.3群体结构分析(STRUCTURE图分析)
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样品要求
项目周期
水稻谷粒外观性状的遗传图谱QTL定位和垩白度相关差异表达基因的共定位研究
实验取材:
研究结果: